Pabongka Rinpoche lahir pada tahun 1878, di sebuah kota bernama Tsawa Li di distrik Yeru Shang di negara bagian Tsang, sebelah utara Lhasa di Tibet. Nama lengkapnya adalah Kyabje Pabongkapa Jetsun Jampa Tenzin Trinley Gyatso Pel Sangpo, yang diterjemahkan sebagai “Pelindung Agung, orang dari Pabongka, Guru yang agung dan mulia yang namanya adalah Sang Penuh Kasih, Penjaga Ajaran Buddha, Samudera Perbuatan Agung Buddha.” Ia juga dikenal secara populer sebagai “Dechen Nyingpo,” yang berarti “Esensi Maha Sukha,” merujuk pada penguasaannya atas ajaran rahasia Buddha Dharma.

Sejak kecil, Pabongka Rinpoche sudah menunjukkan kualitas-kualitas luar biasa dan pada usia tujuh tahun, ia dibawa ke hadapan Sharpa Chuje Lobsang Dargye, salah satu tokoh terkemuka saat itu, yang meramalkan bahwa jika anak itu ditempatkan di Rumah Gyalrong di Biara Sera Mey, sesuatu yang luar biasa akan terjadi pada masa depannya. Kemudian, ia ditemukan sebagai reinkarnasi dari garis Changkya, yang mencakup cendekiawan terkenal Changkya Rolpay Dorje (1717-1786 M). Para Lama dari garis ini telah banyak mengajar di wilayah Mongolia dan China, termasuk di istana kaisar China.

Pabongka belajar dengan Jaba Sonpo Rinpoche, namun Guru Utama atau Pembimbing Spiritualnya adalah Dagpo Lama Rinpoche Jamphel Lhundrup Gyatso. Pabongka Rinpoche adalah meditator yang giat dan menekankan Lamrim, Lojong, dan Mahamudra. Setelah menyelesaikan studinya di Biara Sera, ia mengunjungi Dagpo Lama Rinpoche di guanya dan dikirim ke retret Lamrim di dekatnya.

Menurut Ribur Rinpoche: Dagpo Lama Rinpoche akan mengajarinya topik Lam-rim kemudian Pabongka Rinpoche akan pergi dan merenungkannya. Kemudian ia akan kembali untuk menjelaskan apa yang telah ia pahami: jika ia memperoleh beberapa realisasi, Dagpo Lama Rinpoche akan mengajarinya lebih lanjut dan Pabongka Rinpoche akan kembali dan merenungkan itu. Hal ini berlanjut selama sepuluh tahun.

Pabongka Rinpoche terkenal dengan teks pengantar klasiknya, Liberation in the Palm of Your Hand (Pembebasan di Tangan Kita), yang didasarkan pada pengajaran selama 24 hari yang ia berikan pada tahun 1921 di Pertapaan Chuzang dekat Lhasa kepada kumpulan besar biksu, biarawati, dan orang awam, serta komentarnya tentang berbagai buku karya Je Tsongkhapa.